Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC42

RNF149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF149Q8NC42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RNF149Q8NC42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF149Q8NC42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF149Q8NC42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF149Q8NC42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.8 ms