Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAF1Q8N7H5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAF1Q8N7H5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms