Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC155Q8N6L0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC155Q8N6L0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC155Q8N6L0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC155Q8N6L0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms