Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSGALNACT2Q8N6G5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSGALNACT2Q8N6G5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms