Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4K4

RPRML, Reprimo-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMLQ8N4K4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.1 ms