Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC83Q8IWF9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC83Q8IWF9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC83Q8IWF9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC83Q8IWF9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms