Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS6Q8IU80 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMPRSS6Q8IU80 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS6Q8IU80 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms