Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM50Q86XT4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM50Q86XT4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM50Q86XT4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM50Q86XT4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270 ms