Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF3Q86WH2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASSF3Q86WH2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms