Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D4Q7Z3S7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D4Q7Z3S7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms