Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APTXQ7Z2E3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APTXQ7Z2E3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APTXQ7Z2E3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms