Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP3Q7RTS5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP3Q7RTS5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms