Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.47■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
HECW1Q76N89 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
HECW1Q76N89 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
HECW1Q76N89 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.31■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
HECW1Q76N89 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
HECW1Q76N89 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms