Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMIM5Q71RC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
SMIM5Q71RC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SMIM5Q71RC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMIM5Q71RC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SMIM5Q71RC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms