Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHSY3Q70JA7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHSY3Q70JA7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHSY3Q70JA7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms