Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS1Q6ZTW0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPGS1Q6ZTW0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPGS1Q6ZTW0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TPGS1Q6ZTW0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms