Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF111Q6ZNA4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF111Q6ZNA4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF111Q6ZNA4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms