Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD3Q6STE5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCD3Q6STE5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms