Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC27A1Q6PCB7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A1Q6PCB7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A1Q6PCB7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A1Q6PCB7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms