Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK5Q6P3R8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK5Q6P3R8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms