Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 FANCA-211ENST00000563510 633 ntTSL 59.47□□□□□ -0.892e-11■■■■■ 64.9
PRPF8Q6P2Q9 SNAP25-AS1-201ENST00000421143 808 ntTSL 57.48□□□□□ -1.212e-12■■■■■ 64.8
PRPF8Q6P2Q9 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.82e-12■■■■■ 64.8
PRPF8Q6P2Q9 SHMT2-228ENST00000557302 457 ntTSL 311.41□□□□□ -0.586e-13■■■■■ 64.7
PRPF8Q6P2Q9 PTPRA-208ENST00000455631 1107 ntTSL 520.69■□□□□ 0.99e-12■■■■■ 64.7
PRPF8Q6P2Q9 STAT1-211ENST00000464072 865 ntTSL 212.63□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 64.7
PRPF8Q6P2Q9 MFSD9-202ENST00000411991 1183 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 64.7
PRPF8Q6P2Q9 SEC22C-211ENST00000451653 5955 ntTSL 1 (best)6.25□□□□□ -1.412e-19■■■■■ 64.6
PRPF8Q6P2Q9 TAF1B-206ENST00000469895 681 ntTSL 319.02■□□□□ 0.642e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 ADPGK-205ENST00000562823 514 ntTSL 418.46■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 PRMT3-205ENST00000526583 532 ntTSL 318.05■□□□□ 0.482e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF1B-203ENST00000404869 505 ntTSL 516.07■□□□□ 0.162e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF1B-207ENST00000480197 554 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-230ENST00000551695 624 ntTSL 313.29□□□□□ -0.284e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 FAM207A-205ENST00000485207 504 ntTSL 212.27□□□□□ -0.452e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF1B-208ENST00000490432 620 ntTSL 310.58□□□□□ -0.722e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-224ENST00000550106 3349 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.974e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF1B-202ENST00000402170 715 ntTSL 58.38□□□□□ -1.072e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TIGAR-203ENST00000539671 160 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TAX1BP1-206ENST00000422800 570 ntTSL 37.35□□□□□ -1.232e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-203ENST00000397792 2484 ntTSL 1 (best)4.91□□□□□ -1.624e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-210ENST00000546951 579 ntTSL 34.08□□□□□ -1.764e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-202ENST00000356859 3942 ntTSL 24.02□□□□□ -1.774e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.834e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TOPBP1-208ENST00000511439 1142 ntTSL 53.12□□□□□ -1.912e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TOPBP1-206ENST00000508524 618 ntTSL 52.81□□□□□ -1.962e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TOPBP1-210ENST00000572787 402 ntTSL 41.95□□□□□ -2.12e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 CASD1-205ENST00000471944 2263 ntTSL 21.71□□□□□ -2.132e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TAX1BP1-205ENST00000418691 641 ntTSL 41.65□□□□□ -2.152e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 OTUD4-207ENST00000509517 617 ntTSL 31.39□□□□□ -2.193e-66■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 VEZT-236ENST00000552306 789 ntTSL 50.93□□□□□ -2.264e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 TAX1BP1-211ENST00000490455 591 ntTSL 20.26□□□□□ -2.372e-17■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 PRPF40A-212ENST00000545856 1358 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 PRPF40A-201ENST00000354363 1622 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.917e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 NFAT5-204ENST00000426654 14219 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.177e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.297e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.397e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.467e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.597e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.767e-11■■■■■ 64.5
PRPF8Q6P2Q9 POLE-214ENST00000539618 299 ntTSL 37.45□□□□□ -1.225e-16■■■■■ 64.4
PRPF8Q6P2Q9 PTAR1-204ENST00000467511 530 ntTSL 24.07□□□□□ -1.761e-14■■■■■ 64.4
PRPF8Q6P2Q9 TNKS1BP1-202ENST00000427750 1946 ntTSL 216.04■□□□□ 0.163e-17■■■■■ 64.4
PRPF8Q6P2Q9 IPO7-202ENST00000527431 607 ntTSL 417.71■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 64.3
PRPF8Q6P2Q9 EGF-207ENST00000509996 1464 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.355e-25■■■■■ 64.2
PRPF8Q6P2Q9 EGF-201ENST00000265171 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.085e-25■■■■■ 64.2
PRPF8Q6P2Q9 EGF-206ENST00000509793 4489 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.155e-25■■■■■ 64.2
PRPF8Q6P2Q9 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.245e-25■■■■■ 64.2
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.235e-25■■■■■ 64.2
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.461e-9■■■■■ 64.2
PRPF8Q6P2Q9 CNOT1-214ENST00000568917 1317 ntTSL 57.42□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 64.2
PRPF8Q6P2Q9 NSUN2-204ENST00000505264 472 ntTSL 48.11□□□□□ -1.112e-17■■■■■ 64.1
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 23.54□□□□□ -1.845e-22■■■■■ 64
PRPF8Q6P2Q9 MIR636-201ENST00000384825 99 ntBASIC7.6□□□□□ -1.196e-12■■■■■ 64
PRPF8Q6P2Q9 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.586e-22■■■■■ 64
PRPF8Q6P2Q9 INTS8-207ENST00000520526 2482 ntTSL 1 (best)3.06□□□□□ -1.922e-8■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 CNOT11-202ENST00000420107 552 ntTSL 22.94□□□□□ -1.945e-9■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 DYNC1H1-211ENST00000556791 938 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 NOL11-203ENST00000580833 815 ntTSL 53.67□□□□□ -1.824e-9■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 WDR33-203ENST00000408998 583 ntTSL 417.04■□□□□ 0.322e-12■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP1B3-204ENST00000466678 1708 ntTSL 311.13□□□□□ -0.632e-33■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-33■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.432e-33■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP1B3-203ENST00000465172 1951 ntTSL 25.67□□□□□ -1.52e-33■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-205ENST00000523281 756 ntTSL 55.28□□□□□ -1.565e-7■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP1B3-207ENST00000484727 657 ntTSL 24.58□□□□□ -1.682e-33■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP1B3-206ENST00000482635 569 ntTSL 53.95□□□□□ -1.782e-33■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP1B3-208ENST00000486782 229 ntTSL 22.74□□□□□ -1.972e-33■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP1B3-209ENST00000487199 421 ntTSL 30.89□□□□□ -2.272e-33■■■■■ 63.9
PRPF8Q6P2Q9 CCDC57-213ENST00000581625 491 ntTSL 513.22□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 63.8
PRPF8Q6P2Q9 CCDC57-212ENST00000578910 796 ntTSL 512.39□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 63.8
PRPF8Q6P2Q9 TEX10-204ENST00000535814 3006 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.134e-12■■■■■ 63.8
PRPF8Q6P2Q9 ETNK1-204ENST00000539974 441 ntTSL 20.45□□□□□ -2.349e-12■■■■■ 63.8
PRPF8Q6P2Q9 DDX39A-204ENST00000586558 1127 ntTSL 215.94■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 63.7
PRPF8Q6P2Q9 DDX39A-212ENST00000590260 988 ntTSL 215.38■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 63.7
PRPF8Q6P2Q9 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.471e-13■■■■■ 63.7
PRPF8Q6P2Q9 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.521e-13■■■■■ 63.7
PRPF8Q6P2Q9 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.611e-13■■■■■ 63.7
PRPF8Q6P2Q9 CDC25B-208ENST00000480816 807 ntTSL 514□□□□□ -0.174e-9■■■■■ 63.6
PRPF8Q6P2Q9 KSR1-218ENST00000583525 428 ntTSL 29.38□□□□□ -0.916e-12■■■■■ 63.6
PRPF8Q6P2Q9 FAM60A-208ENST00000543615 669 ntTSL 515.72■□□□□ 0.112e-12■■■■■ 63.5
PRPF8Q6P2Q9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.22e-12■■■■■ 63.5
PRPF8Q6P2Q9 FAM60A-209ENST00000544921 845 ntTSL 44.66□□□□□ -1.662e-12■■■■■ 63.5
PRPF8Q6P2Q9 FAM60A-202ENST00000448582 3111 ntTSL 1 (best)3.64□□□□□ -1.832e-12■■■■■ 63.5
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 28.12□□□□□ -1.116e-22■■■■■ 63.5
PRPF8Q6P2Q9 SMCHD1-204ENST00000581226 459 ntTSL 3-0.69□□□□□ -2.522e-11■■■■■ 63.5
PRPF8Q6P2Q9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 63.5
PRPF8Q6P2Q9 SCFD1-210ENST00000553693 490 ntTSL 31.75□□□□□ -2.132e-7■■■■■ 63.5
PRPF8Q6P2Q9 LIG3-207ENST00000586119 565 ntTSL 310.24□□□□□ -0.779e-8■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 LIG3-216ENST00000593099 4664 ntTSL 28.28□□□□□ -1.089e-8■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 LIG3-201ENST00000262327 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.178e-8■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.238e-8■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC16A1-AS1-202ENST00000416193 742 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.473e-11■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC16A1-AS1-203ENST00000420168 900 ntTSL 213.89□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.053e-11■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 63.4
PRPF8Q6P2Q9 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 63.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 4530.4 ms