Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LGALS9CQ6DKI2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS9CQ6DKI2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS9CQ6DKI2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms