Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LGSNQ5TDP6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGSNQ5TDP6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms