Protein–RNA interactions for Protein: Q5TBE3

C9orf153, Uncharacterized protein C9orf153, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf153Q5TBE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf153Q5TBE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf153Q5TBE3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms