Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBAP2Q5T6F2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBAP2Q5T6F2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBAP2Q5T6F2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms