Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4I8

C6orf52, Putative uncharacterized protein C6orf52, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52Q5T4I8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf52Q5T4I8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf52Q5T4I8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
C6orf52Q5T4I8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf52Q5T4I8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms