Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC122Q5T0U0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC122Q5T0U0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC122Q5T0U0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms