Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF678Q5SXM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF678Q5SXM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF678Q5SXM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF678Q5SXM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms