Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PERM1Q5SV97 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PERM1Q5SV97 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PERM1Q5SV97 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms