Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC6Q5RKV6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC6Q5RKV6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC6Q5RKV6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms