Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT1Q5JUK3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNT1Q5JUK3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT1Q5JUK3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms