Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3AQ59EK9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNDC3AQ59EK9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC3AQ59EK9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3AQ59EK9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC3AQ59EK9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3AQ59EK9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3AQ59EK9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3AQ59EK9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms