Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGO2Q562F6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGO2Q562F6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms