Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC58Q4VC31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC58Q4VC31 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC58Q4VC31 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms