Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01620Q4KN68 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC01620Q4KN68 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01620Q4KN68 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms