Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C1Q4G0N8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9C1Q4G0N8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C1Q4G0N8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1039.5 ms