Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL9Q3SXZ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTLL9Q3SXZ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL9Q3SXZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL9Q3SXZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL9Q3SXZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL9Q3SXZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL9Q3SXZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms