Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTC1Q2NKJ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTC1Q2NKJ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTC1Q2NKJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms