Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCTN1Q2MV58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCTN1Q2MV58 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCTN1Q2MV58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCTN1Q2MV58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms