Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SPHKAPQ2M3C7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SPHKAPQ2M3C7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SPHKAPQ2M3C7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SPHKAPQ2M3C7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SPHKAPQ2M3C7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SPHKAPQ2M3C7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms