Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ISXQ2M1V0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ISXQ2M1V0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms