Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRNQ16849 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRNQ16849 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRNQ16849 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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