Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGISQ16647 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGISQ16647 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTGISQ16647 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms