Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTF1Q16619 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTF1Q16619 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTF1Q16619 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms