Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCAQ16586 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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