Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK4Q16099 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK4Q16099 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK4Q16099 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK4Q16099 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK4Q16099 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK4Q16099 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK4Q16099 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK4Q16099 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms