Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TAF1AQ15573 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1AQ15573 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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