Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R7Q15435 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R7Q15435 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R7Q15435 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R7Q15435 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPP1R7Q15435 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.8 ms