Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.53e-14■■■■■ 42.9
PCBP1Q15365 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-14■■■■■ 42.9
PCBP1Q15365 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 42.9
PCBP1Q15365 PHF1-207ENST00000479029 933 ntTSL 218.53■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 42.8
PCBP1Q15365 PHF1-204ENST00000427826 862 ntTSL 316.91■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 42.8
PCBP1Q15365 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.591e-8■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 216.38■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 GORASP2-202ENST00000442798 1976 ntTSL 215.72■□□□□ 0.114e-21■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 GORASP2-207ENST00000486498 2096 ntTSL 214.54□□□□□ -0.084e-21■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 GORASP2-209ENST00000493692 951 ntTSL 514.53□□□□□ -0.084e-21■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.14e-21■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 42.7
PCBP1Q15365 PCBP2-217ENST00000550520 753 ntTSL 312.01□□□□□ -0.491e-17■■■■■ 42.6
PCBP1Q15365 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.526e-8■■■■■ 42.5
PCBP1Q15365 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.26e-8■■■■■ 42.5
PCBP1Q15365 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.786e-8■■■■■ 42.5
PCBP1Q15365 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.366e-8■■■■■ 42.5
PCBP1Q15365 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 42.3
PCBP1Q15365 WBP2-209ENST00000589236 747 ntTSL 214.58□□□□□ -0.081e-65■■■■■ 42.3
PCBP1Q15365 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 42.2
PCBP1Q15365 TMEM214-208ENST00000460665 1967 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-11■■■■■ 42.2
PCBP1Q15365 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 42.1
PCBP1Q15365 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 42.1
PCBP1Q15365 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 42.1
PCBP1Q15365 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 42.1
PCBP1Q15365 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-210ENST00000481084 2343 ntTSL 217.15■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-204ENST00000414373 1638 ntTSL 515.71■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-219ENST00000640747 1813 ntTSL 515.63■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-212ENST00000525456 1020 ntTSL 515.15■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-209ENST00000472016 568 ntTSL 215.07■□□□□ 05e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-202ENST00000392834 1817 ntTSL 214.82□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-207ENST00000460183 1058 ntTSL 214.23□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-218ENST00000640102 1195 ntTSL 513.37□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-206ENST00000445653 583 ntTSL 312.35□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 DPAGT1-205ENST00000442480 999 ntTSL 59.41□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 42
PCBP1Q15365 TSG101-203ENST00000535077 685 ntTSL 322.12■■□□□ 1.139e-14■■■■■ 41.9
PCBP1Q15365 TSG101-206ENST00000542488 304 ntTSL 54.05□□□□□ -1.769e-14■■■■■ 41.9
PCBP1Q15365 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 41.8
PCBP1Q15365 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-227ENST00000602056 861 ntTSL 225.86■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.622e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.415e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.415e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-217ENST00000598493 808 ntTSL 522.99■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 222.84■■□□□ 1.251e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.235e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-212ENST00000596125 644 ntTSL 222.59■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 222.23■■□□□ 1.151e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 AL020996.2-201ENST00000559265 568 ntTSL 422.2■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EMILIN1-202ENST00000433140 1431 ntTSL 222.12■■□□□ 1.135e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.131e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.091e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.057e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 321.07■□□□□ 0.965e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 521.07■□□□□ 0.965e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 GTPBP3-205ENST00000594018 934 ntTSL 520.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.917e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-206ENST00000589960 307 ntTSL 320.25■□□□□ 0.837e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-205ENST00000589372 1450 ntTSL 220.05■□□□□ 0.87e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 319.77■□□□□ 0.765e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.725e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 419.27■□□□□ 0.684e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 519.16■□□□□ 0.665e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 CKB-202ENST00000553528 1170 ntTSL 218.94■□□□□ 0.621e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.475e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-205ENST00000413686 769 ntTSL 317.72■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.425e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 CKB-210ENST00000554989 625 ntTSL 217.55■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-209ENST00000462515 577 ntTSL 317.37■□□□□ 0.375e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.327e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 416.76■□□□□ 0.274e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 516.76■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.214e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SLC38A5-203ENST00000429543 656 ntTSL 516.14■□□□□ 0.175e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-209ENST00000490459 1242 ntTSL 215.89■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SMURF1-203ENST00000472627 825 ntTSL 215.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-212ENST00000586128 752 ntTSL 415.26■□□□□ 0.034e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 215.03■□□□□ -01e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -05e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.145e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 41.6
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