Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX17Q15036 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX17Q15036 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX17Q15036 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms